Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms