Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F3O00716 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F3O00716 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F3O00716 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F3O00716 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F3O00716 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F3O00716 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F3O00716 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms