Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms