Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms