Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms