Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms