Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms