Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms