Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC160A6NGH7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms