Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS37CA5D8V6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS37CA5D8V6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS37CA5D8V6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS37CA5D8V6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS37CA5D8V6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS37CA5D8V6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS37CA5D8V6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS37CA5D8V6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS37CA5D8V6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS37CA5D8V6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS37CA5D8V6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS37CA5D8V6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS37CA5D8V6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms