Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
V9GYV3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
V9GYV3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
V9GYV3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms