Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
U3KPZ7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KPZ7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KPZ7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KPZ7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KPZ7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KPZ7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KPZ7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KPZ7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KPZ7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KPZ7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KPZ7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KPZ7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KPZ7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KPZ7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KPZ7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KPZ7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KPZ7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KPZ7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KPZ7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KPZ7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KPZ7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KPZ7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KPZ7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KPZ7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KPZ7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KPZ7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KPZ7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KPZ7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KPZ7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms