Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms