Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C2

EMILIN1, EMILIN-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN1Q9Y6C2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EMILIN1Q9Y6C2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EMILIN1Q9Y6C2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms