Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms