Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SRPRBQ9Y5M8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms