Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms