Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms