Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms