Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERGIC3Q9Y282 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERGIC3Q9Y282 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms