Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms