Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms