Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms