Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms