Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms