Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms