Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA11Q9UKX5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms