Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STAG3Q9UJ98 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms