Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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RABGEF1Q9UJ41 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RABGEF1Q9UJ41 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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RABGEF1Q9UJ41 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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