Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms