Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms