Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWAP70Q9UH65 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWAP70Q9UH65 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWAP70Q9UH65 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWAP70Q9UH65 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWAP70Q9UH65 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWAP70Q9UH65 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SWAP70Q9UH65 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SWAP70Q9UH65 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWAP70Q9UH65 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SWAP70Q9UH65 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWAP70Q9UH65 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWAP70Q9UH65 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWAP70Q9UH65 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SWAP70Q9UH65 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms