Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CC2D2AQ9P2K1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CC2D2AQ9P2K1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CC2D2AQ9P2K1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC33.76■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC33.76■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC33.76■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CC2D2AQ9P2K1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CC2D2AQ9P2K1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms