Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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