Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms