Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABRACLQ9P1F3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms