Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms