Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms