Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NDE1Q9NXR1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms