Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC52A1Q9NWF4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A1Q9NWF4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms