Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms