Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP2Q9NUQ7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms