Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMC4Q9NTJ3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms