Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms