Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MID1IP1Q9NPA3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms