Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms