Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms