Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LGR6Q9HBX8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR6Q9HBX8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms