Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms