Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms